Minato mengurus timnya saat Perang Dunia Ninja Ketiga sedang bergejolak. Karena itu dia punya dua tanggung jawab yaitu menjadi ninja Konoha di peperangan sekaligus melatih timnya.
Saat itu Minato harus dikirim ke garis depan peperangan, di sinilah Minato jadi "Pahlawan Konoha" karena dia datang saat ninja Konoha di garis depan lainnya kalah jumlah, tapi Minato sendirian bisa kalahkan ribuan ninja lawan.
Namun sebelumnya, Minato memberikan Kakashi tanggung jawab untuk menjalankan misi menghancurkan jembatan Kannabi yang jadi akses logistik desa Iwa. Jika hancur maka logistik mereka terhambat.
Dalam misi ini Kakashi yang Jonin memimpin Obito dan Rin yang Chuunin, namun mereka bentrok dengan ninja Iwa dan berakhir dengan inside Obito.
Tak lama setelah itu Minato datang dan menolong Kakashi serta Rin dari ninja Iwa. Lalu Minato dan Kakashi melanjutkan misi menghancurkan jembatan Kannabi. Di sini, Minato memang sedikit terlambat.
Kematian Rin adalah rencana Madara untuk membuat Obito jadi jahat dan mau mengikuti rencana Mugen Tsukuyomi-nya.
Metodenya adalah dengan memanipulasi ninja desa Kiri untuk menjadikan Rin Jinchuriki Isobu lalu mengamuk di Konoha. Selain itu Madara juga menggunakan segel yang sama seperti di Obito di jantungnya agar tak bisa bunuh diri (untuk memastikan Kakashi yang membunuh Rin).
Sebelum menjalankan misi ini, Madara memastikan kalau Minato sedang dalam misi yang jauh dari desa dan jauh dari Kakashi dan Rin, sehingga Minato tak akan bisa menolong kedua muridnya.
Rencana Madara ini berhasil, berakhir dengan kematian Rin dan Obito yang menjadi jahat.
Minato ninja yang sangat cepat kok terlambat menolong murid-muridnya? Dalam insiden Obito, memang Minato sedikit terlambat untuk hadir.
Namun Minato saat itu ada di garis depan perang dan melawan banyak musuh, karena itu dia jadi terlambat datang ke timnya.
Sementara dalam insiden Rin memang sudah direncanakan Madara agar Minato tidak datang membantu.
Jika Minato ada di lokasi yang relatif dekat, dia cukup cepat untuk menolong orang-orang yang ia sayangi, seperti melindungi Naruto dari "Pria Bertopeng" alias Obito, meskipun dia terlampat menolong Kushina yang mana Kurama sudah dikeluarkan Obito.
Nah jadi itu alasan kenapa Minato telat menolong murid-muridnya, bagaimana menurutmu?